兒童白血病的發(fā)生是由于相關染色體和基因在患兒的發(fā)育過程中出現了變異，目前已知慢性髓性白血病通常是由一種叫“費城染色體（Ph）”的染色體變異引起的。費城染色體指的是染色體9號和22號之間的易位（記為t(9;22）），導致BCR和ABL基因融合，形成BCR-ABL融合基因。當骨髓中的造血細胞不經過正常的成熟進程而繁殖迅速，這些不正常的細胞就會在骨髓中越來越多，形成白血病細胞。白血病細胞會擠占正常細胞的生存空間，并能迅速溢出進入血流，并通過血液到達身體的其他部位，如淋巴結、脾、肝、中樞神經系統(tǒng)（腦和脊髓）、睪丸，或其他器官，形成浸潤，影響其他細胞的正常功能，導致白血病的各種癥狀。大多數情況下，白血病是發(fā)生在白細胞上的，但也有一些白血病是發(fā)生在其它類型的血細胞上。