基孔肯雅熱和瘧疾在病原體、傳播媒介、癥狀、診斷方式、治療方式等方面上存在不同。

1. 病原體：基孔肯雅熱由基孔肯雅病毒引起，屬于披膜病毒科甲病毒屬；瘧疾則是由瘧原蟲引起，瘧原蟲有多種，如間日瘧原蟲、惡性瘧原蟲等。

2. 傳播媒介：基孔肯雅熱主要通過埃及伊蚊和白紋伊蚊叮咬傳播；瘧疾主要通過按蚊叮咬傳播，按蚊種類眾多，不同地區(qū)傳播瘧疾的按蚊種類有差異 。

3. 癥狀：基孔肯雅熱主要癥狀為突然發(fā)熱、關(guān)節(jié)疼痛，疼痛較為劇烈，還可伴有皮疹、頭痛、肌肉痛等；瘧疾典型癥狀為周期性發(fā)作的寒戰(zhàn)、高熱、大汗，發(fā)作后癥狀可緩解，還可能有貧血、脾腫大等表現(xiàn)。

4. 診斷方式：基孔肯雅熱主要依靠病毒核酸檢測(cè)、血清學(xué)檢測(cè)等方法診斷；瘧疾主要通過血涂片查找瘧原蟲來確診，也可采用瘧原蟲抗原檢測(cè)等方法。

5. 治療方式：基孔肯雅熱目前尚無特效抗病毒藥物，主要是對(duì)癥治療，如退熱、止痛等；瘧疾根據(jù)瘧原蟲種類不同，選用不同的抗瘧藥物進(jìn)行治療，如氯喹、青蒿素類藥物等。

日常要注意做好防蚊措施，如使用蚊帳、蚊香，穿長(zhǎng)袖衣物等，避免前往瘧疾和基孔肯雅熱流行地區(qū)。若出現(xiàn)相關(guān)癥狀，應(yīng)及時(shí)就醫(yī)，嚴(yán)格遵醫(yī)囑進(jìn)行檢查和治療，切不可自行用藥，以免延誤病情。