當(dāng)人體被帶病毒的蚊蟲叮蛟后，病毒即進(jìn)入血循環(huán)中。發(fā)病與否，一方面取決于病毒的毒力與數(shù)量，另一方面取決于機(jī)體的反應(yīng)性及防御機(jī)能。當(dāng)人體抗體病能力強(qiáng)時(shí)，病毒即被消滅。如人體抵抗力降低，而感染病毒量大，毒力強(qiáng)時(shí)，病毒經(jīng)血循環(huán)可突破血腦屏障侵入中樞神經(jīng)系統(tǒng)，并在神經(jīng)細(xì)胞內(nèi)復(fù)制增殖，導(dǎo)致中樞神經(jīng)系統(tǒng)廣泛病變。不同的神經(jīng)細(xì)胞對(duì)病毒感受不同，以及腦組織在高度炎癥時(shí)引起的缺氧、缺血、營養(yǎng)障礙等，造成中樞病變部位不平衡，如腦膜病變較輕，腦實(shí)質(zhì)病變較重；間腦、中腦病變重，脊髓病變輕。注射百日咳菌苗或患腦囊蟲病者乙腦發(fā)病率明顯高，可能系血腦屏障被破壞之故。潛伏期為4～21天，一般10左右。整個(gè)病程分為三期：①初期：病程第1～3天，有高熱、嘔吐、頭痛、嗜睡；②極期：病程第4～10天，頭痛加劇，自好睡、昏睡至昏迷，驚厥或抽痙，肢體癱瘓或假直，有腦膜刺激征及顱內(nèi)壓增高表現(xiàn)，深度皆迷病人可發(fā)生呼吸衰竭。顱內(nèi)病變部位不同還可出現(xiàn)相應(yīng)神經(jīng)系統(tǒng)癥狀和體征，此期持續(xù)10天左右；③恢復(fù)期：多數(shù)病人體溫下降，神志逐漸清醒，語言功能及神經(jīng)反射逐漸恢復(fù)，少數(shù)人留有失語、癱瘓、智力障礙等，經(jīng)治療在半年內(nèi)恢復(fù)，半年后仍遺留上述癥狀稱之為后遺癥。